Harry Potter (Daniel Radcliffe) กลับมาที่ Hogwarts School of Wizardry เป็นปีที่สองของเขา
หลังจากการเผชิญหน้ากับเอลฟ์ประจำบ้านชื่อด๊อบบี้ (โทบี้ โจนส์) แฮร์รี่ก็หนีไปยังบ้านวีสลีย์พร้อมกับรอน วีสลีย์ (รูเพิร์ต กรินท์) ในรถบินได้
พวกเขามาสายสำหรับรถไฟและต้องนั่งรถไปโรงเรียน เมื่อพวกเขาไปถึงที่นั่น
เหตุการณ์ประหลาดก็บุกเข้ามาในโรงเรียน “เลือดโคลน” (คนในตระกูลมักเกิ้ล) ถูก “กลายเป็นหิน”
โดยสัตว์ประหลาดชั่วร้ายที่ซุ่มซ่อนอยู่ในพื้นที่ เมื่อทุกคนสงสัยว่าเป็น แฮร์รี่
ทั้งสามคนจึงออกเดินทางเพื่อค้นหาผู้กระทำความผิดและค้นหามากกว่าที่พวกเขาต่อรอง
ไดอารี่ของ ทอม ริดเดิ้ล (คริสเตียน โคลสัน) เหตุใด แฮกริด (ร็อบบี้ โคลทราน) จึงถูกไล่ออก
และอะไรคือห้องแห่ง ความลับมีอยู่จริง และทำไมในฮอกวอตส์ถึงน่ากลัวนัก
